Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snrpb2Q9CQI7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpb2Q9CQI7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms