Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp6v0e1Q9CQD8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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