Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim12aQ99PQ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12aQ99PQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12aQ99PQ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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