Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim3Q99PE5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms