Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsnaxip1Q99P25 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsnaxip1Q99P25 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsnaxip1Q99P25 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsnaxip1Q99P25 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsnaxip1Q99P25 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms