Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gins4Q99LZ3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gins4Q99LZ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms