Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap3Q99LM2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk5rap3Q99LM2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms