Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh3bp5lQ99LH9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp5lQ99LH9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp5lQ99LH9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms