Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf2Q99LE6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcf2Q99LE6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms