Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krcc1Q99JT5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krcc1Q99JT5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krcc1Q99JT5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms