Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sirt1Q923E4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sirt1Q923E4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sirt1Q923E4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sirt1Q923E4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms