Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prpf3Q922U1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms