Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts3Q91ZD5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts3Q91ZD5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cts3Q91ZD5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms