Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Krt25Q8VCW2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt25Q8VCW2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms