Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc12Q8R344 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc12Q8R344 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms