Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B4

Eif3c, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3cQ8R1B4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Eif3cQ8R1B4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3cQ8R1B4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3cQ8R1B4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms