Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc137Q8R0K4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc137Q8R0K4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms