Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh16f2Q8K3M1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Rdh16f2Q8K3M1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Rdh16f2Q8K3M1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rdh16f2Q8K3M1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Rdh16f2Q8K3M1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Rdh16f2Q8K3M1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Rdh16f2Q8K3M1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Rdh16f2Q8K3M1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rdh16f2Q8K3M1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rdh16f2Q8K3M1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Rdh16f2Q8K3M1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdh16f2Q8K3M1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Rdh16f2Q8K3M1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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