Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk5rap2Q8K389 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk5rap2Q8K389 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk5rap2Q8K389 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms