Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim68Q8K243 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim68Q8K243 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim68Q8K243 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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