Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrit1Q8K099 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lrit1Q8K099 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrit1Q8K099 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrit1Q8K099 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms