Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prmt5Q8CIG8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prmt5Q8CIG8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms