Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ep400Q8CHI8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ep400Q8CHI8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ep400Q8CHI8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms