Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGU1

Calcoco1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco1Q8CGU1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calcoco1Q8CGU1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Calcoco1Q8CGU1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calcoco1Q8CGU1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms