Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm28Q8CGC6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbm28Q8CGC6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm28Q8CGC6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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