Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Phf20l1Q8CCJ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phf20l1Q8CCJ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms