Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Alx1Q8C8B0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Alx1Q8C8B0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms