Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol9bQ8C7I4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol9bQ8C7I4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apol9bQ8C7I4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol9bQ8C7I4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms