Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe22Q8C6A8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms