Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
4930504O13RikQ8C5Z9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930504O13RikQ8C5Z9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
4930504O13RikQ8C5Z9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
4930504O13RikQ8C5Z9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
4930504O13RikQ8C5Z9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
4930504O13RikQ8C5Z9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms