Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc60Q8C4J0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc60Q8C4J0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms