Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo3Q8BZL8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmo3Q8BZL8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms