Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup54Q8BTS4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms