Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV1

Trmt2a, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt2aQ8BNV1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trmt2aQ8BNV1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt2aQ8BNV1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms