Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trpa1Q8BLA8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpa1Q8BLA8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms