Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop53Q8BK35 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nop53Q8BK35 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nop53Q8BK35 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms