Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
6820408C15RikQ8BJX2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
6820408C15RikQ8BJX2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
6820408C15RikQ8BJX2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms