Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH52

Creb3l2, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l2Q8BH52 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l2Q8BH52 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l2Q8BH52 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l2Q8BH52 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l2Q8BH52 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l2Q8BH52 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Creb3l2Q8BH52 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Creb3l2Q8BH52 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l2Q8BH52 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms