Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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