Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc50Q810U5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc50Q810U5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms