Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms