Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnma8aQ80VM8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnma8aQ80VM8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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