Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim17Q7TPM3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms