Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rph3alQ768S4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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