Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cand1Q6ZQ38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cand1Q6ZQ38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms