Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot1Q6ZQ08 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot1Q6ZQ08 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms