Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms