Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY52

Gm7247, Predicted gene 7247, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7247Q6UY52 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm7247Q6UY52 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7247Q6UY52 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7247Q6UY52 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms