Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr13Q6R5N8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tlr13Q6R5N8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr13Q6R5N8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms