Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Neil2Q6R2P8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms