Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Neil2Q6R2P8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Neil2Q6R2P8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms