Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nudcd1Q6PIP5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nudcd1Q6PIP5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.4 ms